1975年，19岁的比尔·盖茨从美国哈佛大学退学，和他的高中校友保罗·艾伦一起卖basic（beginners'all-purpose symbolic instruction code），又译培基。
培基意思就是“初学者的全方位符式指令代码，是一种设计给初学者使用的程序设计语言。当盖茨还在哈佛大学读书时，他们曾为mits公司的altair编制语言。后来，盖茨和艾伦搬到阿尔伯克基，并在当地一家旅馆房间里创建了微软公司。
1977年，微软公司搬到西雅图的贝尔维尤（雷德蒙德），在那里开发pc的编程软件。
1979年，mits公司关闭，微软公司以修改basic程序为主要业务继续发展。公司创立初期以销售basic解译器为主。当时的计算机爱好者也常常自行开发小型的basic解译器，并免费分发。
微软是少数几个basic解译器的商业生产商，微软basic逐渐成为公认的市场标准。
此后，他们曾经试图以设计msx家庭计算机标准来进入家用计算机市场，但结果不太成功。
1980年，ibm公司选中微软公司为其新pc机编写关键的操作系统软件，这是公司发展中的一个重大转折点。由于时间紧迫，程序复杂，微软公司以5万美元的价格从西雅图的一位程序编制者tim paterson（帕特森）手中买下了一个操作系统qdos的使用权，在进行部分改写后提供给ibm，并将其命名为microsoft dos（disk operating system，磁盘操作系统）。
ibm-pc机的普及使ms-dos取得了巨大的成功，因为其他pc制造者都希望与ibm兼容。ms-dos在很多家公司被特许使用。因此80年代，它成了pc机的标准操作系统。
1983年，微软与ibm签订合同，为ibm pc提供basic解译器，还有操作系统，微软公司的销售额超过1亿美元。随后，微软公司继续为ibm、苹果公司以及无线电器材公司的计算机开发软件。随着微软公司的日益壮大，microsoft与ibm已在许多方面成为竞争对手。
1985年开始发行了microsoft windows1.0，它是windows系列的第一个产品，同时也是是微软第一次对个人电脑操作平台进行用户图形界面的尝试。
1991年，由于利益的冲突，ibm公司、苹果公司解除了与微软公司的合作关系，但ibm与微软的合作关系从未间断过，两个公司保持着既合作又竞争的复杂关系。微软公司的产品包括操作系统软件ms-dos和xenix：xenix是unix操作系统其中一种个人电脑上的版本，由微软公司在1979年开始为intel处理器所开发的，它还能在decpdp-11或是apple lisa电脑执行。xenix继承了unix的特性，xenix具备了多用户多任务的工作环境，符合unix system v的接口规格 （svid）。
1983年，保罗·艾伦患霍奇金氏病离开微软公司，后来成立了自己的公司。艾伦拥有微软公司15%的股份，截止2019年2月23日，艾伦仍列席董事会。
1986年，公司转为公营。盖茨保留公司45%的股权，这使其成为1987年pc产业中的第一位亿万富翁。1992年，公司买进fox公司，迈进了数据库软件市场。
二十世纪90年代中期，微软开始将其产品线扩张到计算机网络领域。微软在1995年8月24日推出了在线服务msn（microsoft network，微软网络）。msn是美国在线的直接竞争对手，也是微软其他网络产品的主打品牌。
1995年8月24日，微软公司发行了内核版本号为4.0的一个混合了16位/32位的windows系统——windows 95，并成为当时最成功的操作系统。
1996年，微软以及美国的广播业巨擘nbc（国家广播公司）联合创立了msnbc，一个综合性的24小时新闻频道以及在线新闻服务供应商。
1997年末，微软收购了hotmail，最早以及最受欢迎的webmail服务商。hotmail被重新命名为msn hotmail，并成为.net passport，一个综合登入服务系统的平台。msn messenger是一个即时信息客户程序，由微软在1999年推出，是美国在线的aol instant messenger（aim）及icq的主要竞争对手。已发展为windows live messenger。
1995年至1999年是微软在中国相继成立了微软中国研究开发中心、微软全球技术支持中心和微软亚洲研究院这三大世界级的科研、产品开发与技术支持服务机构， 微软中国成为微软在美国总部以外功能最为完备的子公司。
2009年7月29日，美国雅虎公司和微软公司宣布，双方已就在互联网搜索和网络广告业务方面进行合作达成协议。这项协议为期10年，雅虎网站将使用微软新推出的“必应”（bing）搜索引擎，微软将获得雅虎核心搜索技术为期10年的独家使用许可权，而雅虎将负责在全球范围内销售两家公司的搜索广告。此外，微软还同意在双方合作的前5年中，雅虎网站营业收入的88%归雅虎所有。
2011年5月10日，微软宣布以85亿美元收购skype。该交易有助于微软吸引更多互联网用户，并在互联网广告市场缩小与谷歌之间的差距。该交易是微软截止2011年为止进行的最大规模的单笔并购交易，超过2007年进行的以60亿美元收购网络广告公司aquantiv交易。
2012年7月31日，微软用拓展版outlook替代消费者网络版hotmail，outlook一般用在企业中。hotmail于1996年推出，是免费在线邮件服务，它将带广告邮件的概念发扬光大。
2012年8月24日，微软推出了其全新的企业logo，这是自1988年以来首次对其企业logo标志进行大幅改动。新的标志将包括一个经常出现在微软产品中的彩色符号，而且microsoft字体也发生改变。微软品牌战略总经理汉森（jeff hansen）称：“新的标志代表了对传统的继承和对未来的期望，可以带来一个新鲜的感受。”
2013年1月9日，微软公司宣布将于3月15日正式关闭即时通讯服务msn。除中国大陆地区之外的全球用户将被转至微软2011年收购的网络视频及语音通讯服务skype。msn用户用原有账户登录skype，就可以看到msn联系人信息，并可使用skype提供的即时通讯、视频通话、手机视频通话和屏幕共享等服务。
2013年9月3日，微软宣布将以54.4亿欧元（约71.7亿美元）收购诺基亚手机业务及其大批专利组合的授权。其中，37.9亿欧元用于收购诺基亚的设备与服务部门，16.5亿欧元用于购买其10年期专利许可证。微软同时将向诺基亚提供与位置技术相关的专利授权。
微软未来有权延长这一专利合作,交易完成之后，“诺基亚”品牌仍将得以保留，3.2万名诺基亚员工将加入微软。微软也将获得诺基亚here平台的授权，并成为诺基亚here业务最大的客户，基于独立的授权协议付费。
2014年1月28日，微软宣布公司旗下云存储服务skydrive更名为onedrive。
2014年2月4日，微软任命内部高管萨蒂亚·纳德拉为新任ceo。
2014年3月2日，微软中国宣布4月8日后不再继续为windows xp用户提供安全保护。
2014年4月8日，windows xp系统正式“退役”。
2014年7月17日，微软公司宣布历史上最大规模的裁员，未来一年微软公司将大幅裁员1.8万名员工，裁员人数占该公司全球12多万名员工总数的14%，其中大部分员工来自微软收购的诺基亚手机业务部门。
2014年9月15日，mojang开发组以及所发行的游戏minecraft被微软以20多亿美元的价格收购。
2015年1月21日，举行windows 10发布会，22日宣布将于2015年内推出office 2016。
2015年1月27日，微软证实surface 2将会停产，意味着该公司将不再生产windows rt系统的平板电脑，变相宣判了这款系统的“死刑”。
2015年3月7日，微软起诉京瓷手机专利侵权，要求美国法院禁售。
2015年3月14日，公司ceo萨蒂亚·纳德拉(satya nadella)宣布进行内部重组，将msn团队转入windows集团，让微软在线门户与旗舰操作系统的联系更加紧密。
2015年3月18日，微软公司宣布，将与360、联想等公司合作，为中国用户免费升级windows 10操作系统。微软将于2015年夏天在190个国家推出windows 10操作系统，届时中国用户可以通过360公司提供的分发和升级服务，与全球用户同步体验到免费的windows 10。联想将成为全球首家在消费产品上全线预装windows 10系统的电脑厂商，腾讯旗下电脑管家也提供一键升级至win10的服务。
2015年7月29日，微软发布新一代操作系统windows 10，这次正版windows7、windows 8、windows8.1用户可免费升级windows 10正式版，windows xp、windows vista等用户则需通过购买获得。
2015年9月，微软2.5亿美元收购以色列安全公司adallom，微软一直希望能进一步完善旗下云产品选择，公司在收购adallom的产品后，将会将其融入到现有的安全系统中，以为包括office 365以及enterprise mobility suite在内的产品提供安全保护。
microsoft edge
2015年9月24日，美国华盛顿州雷德蒙德，百度与微软正式宣布战略合作，百度将成为中国市场上windows 10 microsoft edge浏览器的默认主页和搜索引擎，带给用户更加便捷的搜索服务。同时，百度也将通过“windows10直通车”提供windows 10下载升级服务。
2016年1月12日，微软发布 2016年 度的第一波安全补丁，对于 ie8、9、10 这些旧版本的ie浏览器而言，这也将是它们最后一次获得安全更新，之后微软将彻底停止对它们的支持。
从2016年1月12日开始， 微软将不再为windows 8系统提供技术支持。这意味着几百万的windows 8用户必须升级到windows 8.1或windows 10，否则将不会再收到安全补丁。windows 8一旦升级到windows 8.1，将会在2018年1月9日之前一直得到主流支持，而扩展支持将于2023年1月10日结束。这就是说，微软将会在2023年之前一直为windows 8.1发布安全补丁，但在2018年之后不会为该系统添加新功能。
根据net application的最新统计，windows 8的市场份额为2.8%，而windows 8.1的市场份额为10.3%。windows 8系统2.8%的市场份额意味着有好几百万台安装该系统的电脑将从2016年1月12日起不再收到安全补丁，这些电脑将会更加容易遭受恶意软件和黑客的攻击。
2016年6月1日，微软与小米进一步扩展全球合作伙伴关系，作为合作协议的一部分，小米将在其安卓智能手机和平板电脑上预装微软 office 和 skype。
2016年6月13日，微软官方博客宣布，微软和linkedin公司已经达成了一项最终协议，微软将以每股 196 美元，合计 262 亿美元的全现金收购包括 linkedin 公司的全部股权和净现金。
2017年5月2日，微软举办了windows 10 s系统和全新的surface laptop笔记本电脑发布会。5月10-13日将举行bulid 2017大会。5月23日，将在中国上海举行举行surface pro 5发布会。
2018年7月16日，微软和通用电气宣布，将拓展两家公司之间的合作，将运营技术和信息技术结合起来，以消除工业企业在推进数字化转型项目方面所面临的障碍。
2018年9月，微软宣布为windows 10系统带来了ros支持，所谓ros就是机器人操作系统。此前这一操作系统只支持linux平台， 现在微软正在打造ros for windows。
2018年11月11日，微软在x018上正式宣布收购黑曜石工作室以及inxile entertainment。
2020年1月14日，微软对windows 7终止支持。
2020年6月4日，微软（中国）有限公司新增一条被执行人信息，执行法院为北京市第一中级人民法院，标的95.2215万元。
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