生化棉和过滤棉既有相同点又有不同点，过滤棉一般指白色棉质纤维的滤材，厚度一般在3毫米-50毫米之间，主要用于过滤空气尘埃，附着油漆等细微悬浮粒子等，而生物棉则是由进口粗丝材料不规则缠绞而成的块状过滤材料，也能作为过滤材料来用。但生化棉主要是当细菌屋，让硝化细菌有着床的地方。有了硝化细菌，鱼缸水里的氨才有细菌分解才不至于让鱼生病死亡，所以生化棉和过滤棉还是有差别的但也有共通的地方。
生化棉是一种使用范围很广的滤材，主要起到生化过滤的效果。适用于海水缸、淡水缸和水草缸等观赏类水族箱。它主要用于培养硝化细菌，让硝化菌分解水中有毒的nh3/nh4和no2，转化成无毒的no3。因此可以改善水质，提高鱼类成活率，是一种兼有物理和生化过滤效果的过滤材料。它的弹性好，比表面积较大，不易损坏，同时能有效过滤水中杂物。
而过滤棉主要用于表面处理，油漆涂装、喷涂，精密电子，光学电子，生物制药，食品生产，空气冷却等，这些环境需要流动的空气，但不能有粉尘，所以就需要用过滤棉将粉尘过滤掉，只让洁净的空气在相对封闭的空间里循环起来，从而达到生产运行的需要。