反渗透设备应用的主要目的是过滤水中的污染物和杂质。因此，反渗透设备在运行过程中，会逐渐受到水中一些截留污染物的污染。随着污染物质的不断沉积，固然会造成反渗透膜的污染，从而导致反渗透膜受损，反渗透设备整体性能降低，因此，为了保证反渗透设备的正常运行，有必要定期对反渗透膜以及整体设备进行清洗和维护。
反渗透设备的清洗频率与预处理有着直接关系。通常3～12个月清洗一次，如果每个月都必须要清洗，就需要改善反渗透设备的预处理系统并调整运行参数。如果1～3个月需要清洗一次，就需要提高设备的运行水平，考虑一下是否有必要改进反渗透设备的预处理系统。
在反渗透设备停运一段时间后，当再次使用时也要对反渗透膜进行清洗。如今，绝大大多数反渗透设备都是全自动的，可自动清洗。清洗反渗透膜主要是为了去除沉积在反渗透膜上的杂质，以避免对反渗透膜造成损坏。
虽然大多数反渗透膜系统会有配备预处理系统，尽可能的去除一些污染物，但也只是粗滤，并不能*避免反渗透膜组件受到污染。如果反渗透系统产生了一定程度的污染，没有及时得到清洗，后期附着膜表面的污染物很难*去除。因此，对反渗透系统进行清洗是非常重要的。