医疗事故的赔偿处理需要根据具体的实施情况，法律没有规定具体的处理时间。在医疗事故发生后，三年内可以要求赔偿，我国法律规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。法律另有规定的，依照其规定。但是自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护;有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。
二、怎么提起医疗事故赔偿诉讼
向法院提起医疗事故赔偿诉讼是医疗事故发生后当事人寻求的最后一道保障线，也是最有效力的解决纠纷方式。向法院提起的诉讼，应该注意以下一些问题：
1.起诉要注意诉讼时效制度。向法院诉讼，有时效制度，如果过了诉讼时效，合法的权益最终可能得不到法律的保护。普通时效为两年，但医疗事故属于身体受到伤害所需的赔偿，诉讼时效只有一年，从确定为医疗事故之日起算起。当事人千万不要在协商、调解和等待中，超过诉讼时效。
2.起诉要有合适的原告和被告。原告一般是患者本人，如果死亡的，一般指死者的法定继承人。而被告一般是指医院，主治医生是代表医院的职务行为，一般不能作为医疗纠纷案件的被告。
3.要有合理的赔偿请求。赔偿的数额应根据法律确定在合理的范围之内，如果超过合理的范围，漫天要价，不但得不到法律的支持，而且还要承担额外的诉讼费用。
4.要有支持自己诉讼请求的证据。最主要的是鉴定结论，如果没有鉴定结论，要提供或申请法院调取有关病历资料，并可申请法院进行鉴定。
5.尊重法院的审理程序和秩序。医患双方要相信法律是公正的，如果对一审判决不服，可以通过上诉程序予以解决。医疗一直是一个风险行业，医疗事故的发生，不是医患双方所愿意看到的结局，如果在现有的医疗技术条件下，一味要求医院来承担责任，那么会打击医院和医务人员的探索精神，阻碍医疗技术的提高和医疗科学的发展。但如果对责任事故过于宽容，会使医务人员的责任性逐步丧失。
因此，我们再次强调，对医院及医务人员来说，在现有的设备及医疗条件下，要尽量避免责任事故的发生，也不要在事故发生后，推卸自己的责任;对患者来说，不能因为医疗结果出现意外，不问青红皂白，不顾医学鉴定，聚众妨害医院正常的医疗活动。事故一旦发生，双方应理性地在法律的框架内解决纠纷。
三、如何认定医疗事故赔偿责任
能够构成医疗事故的必须具备如下要件：
1.医疗事故的行为人，必须是经过考核和卫生行政机关批准或承认，取得相应资格的各级各类卫生技术人员。
2.医疗事故的行为人必须有诊疗护理工作中的过失。
3.必须是发生在诊疗护理工作中，也包括为此服务的后勤和管理。
4.给病员造成危害的结果，必须符合法律规定，即死亡、残废、组织器官损伤导致功能障碍的，不及此程度，不能认定为医疗事故。
5.危害行为和危害结果之间，必须有直接的因果关系，否则不能认定为医疗事故。