常因浇水过多或排水不良，使细菌或真菌侵入茎部组织而引起仙人掌腐烂。其症状最初发生在茎的基部，出现褐色水渍状斑纹，组织软化而腐烂，以后向上蔓延，以致全株死亡。由细菌引起的仙人掌腐烂，病斑部分因细菌粘液的漏出而呈脂状，由真菌引起的仙人掌腐烂，受病部分表面出现霉状物。茎腐烂病的发生往往在温暖多湿的雨季，或在早春气温开始回升时。在发病季节应严格控制浇水，保持充足的光照和良好的通风条件。
发现病株后，应立即用利刀割除其受害部分，直至呈现出健康组织为止，伤面用硫磺粉或草木灰涂抹，节制浇水或换盆，放置在日光充足，通风良好的地方。如植株基部腐烂严重，则可将上端完好部分割下，另行扦插或嫁接。