从使用介质上来说，物镜有干镜、油镜、水镜等之分，不同的样品需要或适用的介质不同，也就需要匹配不同的物镜。
从用途上来说，物镜有生物物镜、相差物镜、荧光物镜、偏光物镜、金相物镜、超分辨物镜、共聚焦物镜等，不同的实验需求也需要针对性的选择。
从放大倍数上来说，物镜有0.7x、0.25x、0.5x、0.75x、1x、1.25x、2.5x、4x、5x、10x、15x、20x、40x、50x、60x、63x1、00x、150x等，需要根据不同的样品需求来选择。
从分辨率上来说，同样放大倍数的物镜也有不同分辨率的选择，比如100x物镜的数值孔径就有0.85、0.9、1.0、1.25、1.3等可选，或者有可调整数值孔径的校正环进行实时的调整。
总之，医用光学显微镜物镜的选择还是很多的，需要根据每一个不同的实验要求来进行针对性的选择，才能实理想的效果。