气囊泵控制器内置一个小型空压机，提供压缩空气，可满足静水位在60米以内的工况要求。若水位深度较深，可以加装落管部件，使更深层的地下水样品进入到气囊泵。 为了确保对地下水的低扰动，气囊泵还可选择泄降探头，当采样过程中地下水水位的沉降过大时，可以自动停止取样，等待水位的恢复。
采用12v的直流电源
控制器通过定时器组合来控制内置便携式压缩机的启动和关闭时间。当压缩机运行的时候，空气会被打入到井下气囊泵的气囊及外壁内侧空间里。空气会挤压气囊将气囊内的液体挤压出来，而当空气压缩机停止的时候，气囊里的空气会被排出气囊，并且让水样进入到气囊内。