傅立叶变换红外光谱仪的原理是将可见转换为红外光，通过旋转和拉伸分子的振动，并测量其中的吸收特性以确定分子的构造。当把红外光束聚集在特定区域时，建立一个称为掩模的环境，使物质在红外能量场中拆解，然后在模式上检测分子中吸收的能量。
通过该光谱仪可以准确地测量分子的运动，分析分子的结构和功能。可以同时测量多个分子，从而反映了它们之间的相互作用。在离子膜的研究中，能够快速准确地探测膜的厚度、拉伸常数和极性等参数。
此外，可用于检测水分、酸碱度、溶液中的固有离子和结构的改变，可以应用于材料和化学研究，也可以用于病理学研究。具有高灵敏度和快速反应，特别是该仪器可以实时检测并获得复杂样品的结构和性质，并能与其他分析仪器进行结合获得更有价值的结果。
由于傅立叶变换红外光谱仪技术的出现和发展，可以更快更准确地测量分子间结构、拉伸常数、极性、扩散系数等参数，大大提高了分析精度，为研究者提供了精确可靠的数据，帮助他们更好地了解和研究物质的结构和性质。