dna甲基化存在于大多数真核生物中,一般发生在cpg双核苷酸中胞嘧啶的5’utr区,起调控作用。cpg的胞嘧啶大概有80%被甲基化,20%处于基因调控区的cpg岛中。bsp甲基化测序(bisulfite genomic sequencing pcr)的原理通过对基因组dna进行重亚硫酸盐处理,非甲基化的胞嘧啶被脱氨基而转变成*,在随后的pcr反应中*转变成胸腺嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不能被脱氨基,在反应完成时被保留,我们将扩增得到的pcr产物进行ta克隆测序,就可以分析甲基化发生的具体情况。该方法实验结果准确性高,是甲基化检测的金标准。通过对疾病及正常对照样本的靶基因进行甲基化分析,在研究肿瘤发生机制及早期诊断等方面均具有重要的临床意义。
实验流程
q:常见的甲基化测定方法有哪些,优缺点是什么?
常见方法
优缺点
msp法(methylation-specific pcr,msp):重亚硫酸盐处理基因组dna,分别设计针对甲基化和非甲基化序列的引物进行pcr。通过电泳检测msp扩增产物,如果对甲基化dna链的引物能得到扩增片段,则说明该位点存在甲基化;反之,说明被检测的位点不存在甲基化。
无需挑克隆测序,步骤简单,但对引物设计的要求较高,容易出现pcr假阳性,影响实验结果分析。
bsp法(bisulfite sequencing pcr ,bsp):重亚硫酸处理基因组dna,设计bsp引物扩增,将pcr产物克隆至t载体测序,分析cpg位点是否发生甲基化。
可明确样本待测区段每个cg位点的甲基化程度;受实验方法和价格因素限制无法高通量。
高分辨率熔解曲线法(high resolution melting ,hrm):重亚硫酸处理基因组dna,未甲基化的胞嘧啶经pcr扩增后转变成胸腺嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不变,导致样品中的gc含量发生改变后溶解温度变化,从而进行分析。
检测方法高通量,但是无法明确每个cg位点的甲基化程度。
客户须知:
实物
数据信息
实验周期
客户提供
待测样本
待测序列信息
7周或以上
我们提供
无
基本实验步骤、测序报告、圈点图
收费标准
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