医用激光显微镜的种类就越来越多，按工作介质分，医用激光显微镜可分为气体医用激光显微镜、固体医用激光显微镜、半导体医用激光显微镜和染料医用激光显微镜4大类。近来还发展了自由电子医用激光显微镜，其工作介质是在周期性磁场中运动的高速电子束，激光波长可覆盖从微波到x射线的广阔波段。按工作方式分，有连续式、脉冲式、调q和超短脉冲式等几类。大功率医用激光显微镜通常都是脉冲式输出。各种不同种类的医用激光显微镜所发射的激光波长已达数千种，长的波长为微波波段的0.7毫米，短波长为远紫外区的210埃，x射线波段的医用激光显微镜也正在研究中。
医用激光显微镜是能发射激光的装置。1954年制成了*台微波量子放大器，获得了高度相干的微波束。1958年a.l.肖洛和c.h.汤斯把微波量子放大器原理推广应用到光频范围，并指出了产生激光的方法。1960年t.h.梅曼等人制成了*台红宝石医用激光显微镜。1961年a.贾文等人制成了氦氖医用激光显微镜。1962年r.n.霍耳等人创制了砷化镓半导体医用激光显微镜。
所有镜头表面必须保持清洁，落在镜头表面的灰尘，可用吸耳球吹去，也可用 软毛刷轻轻的掸去掉。
当镜头表面沾有油污或指纹时，可用脱脂棉蘸少许无水乙醇和的混合液（3:7）轻轻擦拭。
不能用有机溶液清擦其它部件表面，特别是塑料零件，可用软布蘸少量中性洗涤剂清擦。
在任何情况下操作人员不能用棉团、干布块或干镜头纸擦试镜头表面，否则会刮伤镜头表面，严重损坏镜头，也不要用水擦试镜头，这样会在镜头表面残留一些 水迹，因而可能滋生霉菌，严重损坏显微镜。
医用激光显微镜工作的间歇期间，为了防止灰尘进入镜筒或透镜表面，可将目镜留在镜筒上，或盖上防尘塞，或用防尘罩将仪器罩住。