如果两个分子存在相互作用,那么二者在表达上往往具有某种关联,基于这个原理因此,我们开发了lncrna(包括mrna)共表达分析技术,应用于目标分子的功能预测。本技术利用不断更新的海量数据库(目前已经包括6万张affymetrix 表达谱芯片数据及5000套tcga数据),建立共表达分析流程,预测功能相关基因,并建立功能分类网络、信号通路、蛋白互作网络,通过对数据的深入挖掘,可获得相关的重要蛋白及其功能和所在通路,以指导下一步的 lncrna 功能验证。
本服务项目提供分析结果包括:
1、表一.xls:与目标lncrna/mrna 具有正向和反向共表达关系的基因各500个;
2、表二.xls:共表达基因功能分类网络
3、表三.xls:共表达基因信号通路网络
4、图一.jpg:蛋白互作网络
5、表四.xls:网络元素权重分析
6、完整分析报告.pdf:包括功能预测、靶点基因、正负调控关系及相关文献查询结果分析。
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