从近期情况看，危害较为严重的有番鸭“花肝病”、番鸭细小病毒病、鸭病毒性肝炎，相对较为少见的是鸭瘟，但在个别鸭场发生后发病率和死亡率仍然很高，仍需认真做好本病的防疫工作；细菌性传染病主要有大肠杆菌病、鸭疫里默杆菌病、鸭出血性败血症，其中危害最为严重的是鸭疫里默杆菌病，在不同鸭场普遍存在，并常常和大肠杆菌病、鸭流感、花肝病等混合感染，曲霉菌病也时有发生。
寄生虫病较少有对鸭群造成严重损害的事例和报道，但因鸭特有的饲养方式，鸭体内和体外寄生虫的带虫极为普遍，会影响到鸭只的正常生长；另外有一些营养代谢性疾病和中毒性疾病，如维生素、钙、磷等缺乏症，霉菌毒素、肉霉梭菌毒素中毒等；此外，外伤、肿瘤、脱羽、光过敏、产蛋疲劳症等杂症亦有发生。当前鸭病流行呈以下特点。
禽流感病毒种类多，根据血凝素和神经氨酸酶性质，至少存在144种亚型。研究表明，作为禽流感病毒的贮存宿主，水禽几乎可以感染所有种类的禽流感病毒。高致病性禽流感病毒可以引起不同品种和日龄鸭发病，发病类型复杂。由于鸭群存在一定滴度免疫抗体，疫病的临床表现和病变呈现非典型化。
尽管采取了强制免疫措施，但免疫防控只能减少临床发病、死亡和病毒的污染程度，并不能消除病毒，因此免疫选择可能加快病毒的变异。我国水禽分离的高致病性禽流感病毒株血凝素基因以2.3.2分支为主，该亚型存在变异毒株，可以分为3个亚分支。对于快速型肉鸭，由于养殖密度大，加上雏鸭免疫窗口期存在，发病风险增加。据报道，h9亚型禽流感病毒也可引起雏鸭发病，需要引起重视。
养殖场的养殖规模和密度提高，病原容易在养殖场持续存在，群体的增多使病原在鸭群中传播频繁、流行迅速，病原血清型持续增加。如引起发病的致病性鸭大肠杆菌血清型不断增多，水禽呼肠孤病毒除了引起番鸭“白点病”的经典型番鸭呼肠孤病毒病外，近年来出现了新型呼肠孤病毒。
这种新型病毒宿主范围广，可以感染番鸭、鸭、鹅等多种水禽，可引起雏番鸭和鹅出血性坏死性肝炎和鸭脾坏死症等。养殖场多种疾病的混合感染普遍存在，疫病的临床病型出现多样化、复杂化趋势。大肠杆菌、鸭疫里默杆菌、沙门菌和奇异变形杆菌等感染鸭，均可出现浆膜炎，鸭大肠杆菌和鸭疫里默杆菌混合感染的比例高达60%～70%。