在一般纳税人年审和临时一般纳税人转为一般纳税人过程中，对已使用增值税防伪税控系统但年应税销售额未达到规定标准的一般纳税人，如果会计核算健全，且没有下列情形之一者，不取消其一般纳税人资格。1.虚开增值税专用发.票或者有偷、骗、抗税行为；2.连续3个月未申报或者连续6个月纳税申报异常且无正当理由；3.不按规定保管、使用增值税专用发.票、税控装置，造成严重后果的。对已认定为一般纳税人的新办商贸零售企业，但未从事货物零售业务的，应取消其一般纳税人资格。一般纳税人注销或被取消辅导期一般纳税人资格，转为小规模纳税人时，其存货不作进项税额转出处理，其留抵税额也不予退税。
对于会计核算不健全或未申请办理一般纳税人认定的纳税人，即一般纳税人会计核算不健全，不能够提供准确税务资料的纳税人，或者销售额超过小规模纳税人标准（除其他个人和选择按小规模纳税人纳税的非企业性单位，不经常发生应税行为的企业外）未申请办理一般纳税人认定手续的纳税人，都应按其销售额依照增值税税率计算应纳税额，同时不得抵扣进项税额，也不得使用增值税专用发.票。
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