上海生物芯片有限公司成立于2001年8月，公司由上海创业投资有限公司、中科院上海生命科学研究院、中科院上海微系统与信息技术研究所、复旦大学、交通大学、上海第二医科大学附属瑞金医院、第二军医大学附属东方肝胆医院、国家人类基因组南方研究中心、上海博星基因芯片有限公司、上海华冠生物芯片有限公司和上海复旦张江生物医药股份有限公司等十一家发起单位共同出资
组建而成。2003年2月，公司被国家计委批准建设“生物芯片上海国家生物芯片工程中心”，公司位于上海浦东张江高科技园区生物医药产业基地，占地4万平方米，建筑面积近2万平方米，总投资2.9亿元人民币。


公司和中心将以功能基因组为基础，开展生物芯片应用技术研究和产品开发，建成基因芯片、蛋白芯片、组织芯片以及流体芯片实验室等一系列生物芯片技术平台，通过融资、技术转让、参股、产业合作、股权合作等多种形式和渠道进行生物芯片产业的扩大和集成，形成中国的生物芯片产业化基地。