上海医药工业研究院制药装备研究室的主要工作方向是：医药行业的制药工艺由实验室转化成工业化的过程开发和设计。除此之外，本室具有相应的非标设备设计和压力容器设计能力和资质。同时进行原料药设备的开发和研究，其中包括萃取、浓缩、过滤、干燥、反应器、自动化控制等。