铁山寺国家森林公园是国家林业局批准的国家级森林公园，经盱眙县机构编制委员会批准成立盱眙县铁山寺国家森林公园管理委员会，挂盱眙县铁山寺国家森林公园开发总公司牌子，为隶属于盱眙县政府直属的正科级全民事业单位。公园管委会主要职能是负责铁山寺国家森林公园范围内的旅游资源开发、规划、建设和管理，保护区域内野生动、植物资源、维护平衡；提供休闲场所、游乐项目，进行科普宣传教育，丰富广大游客文化生活。

铁山寺国家森林公园下属单位和部门共8个，职工608人，分别是管委会办公室、开发管理科、财务审计科、铁山寺森林度假村、古城林场、紫金山天文台盱眙铁山寺科普园、天泉湖旅游有限责任公司、化农水库管理所。