南京医药股份有限公司药品物流中心（即南京医药股份有限公司药品分公司）是南京医药股份有限公司主营从事药品批发、新品代理、零售的专业化医药流通部门，2002年底一次性通过国家药品监督管理局“GSP”验收认证，具有较强专业水准的员工团队。该中心现主要面向华东地区各大中小型医药商业企业、医疗机构、社会药房、乡镇卫生院、个人零售等主要客户，经营化学药品、生物制剂、血液制品、中成药、常规医疗器械等四千多个品规（以药品经营许可证为准），并可代办大型医疗器械采购。