“中国科学院南京土壤所科技开发总公司”，体制改革后更名为：中国科家院南京土壤研究所控股的“南京中科院跨克科技有限责任公司”，是我所高新技术产业法人企业。负责管理、协调全所的科技开发、生产性项目和产品的经营，代表我所开展企业的投资、联营或合资等经营活动。近年来已有一百多个开发项目在生产中得到推广应用。在复混肥、专用肥、除草抗病多功能肥、高浓度全营养叶面肥、生物肥料、花卉泥炭肥、物理、化学及生物传感器、土壤与环境分析仪器、农业现代化管理、农田环境数据采集系统、节水灌溉自动监控系统、污水处理、设施渔业工程、生物制品等方面开发出一批又一批新产品，受到用户好评，获得国家、部、省的奖励。其中，复混肥和专用肥曾分别获得江苏省优秀科技成果开发金牛奖、科技专利博览会银奖、商业部科技进步二等奖和全国“星火计划”金奖。所生产的产品均属国内领先水平，部分达到国际先进水平。