1990年湖南省卫生厅、湖南省中医药管理局、湖南中医学院、湖南中医药研究院、湖南医科大学等单位，共同组成了中药剂型改革开发领导小组，成立了专题研究机构，开始规划了全省中药剂型改革开发的系统工程。与此同时，省卫生厅成立了湖南省医药卫生科技开发部，组织领导全省科技开发工作。在此基础上，省卫生厅向省委、省政府领导同志汇报了系统开发湖南国药的基本思路，省委、省政府领导立即作了批示，对这项事业高度重视。随后，省卫生厅向省政府正式上报了湖南省中药剂型改革开发系统工程实施计划，“十五”时期完成400味中药颗粒饮片改革，完成12个系列62个品种优势中成药的新剂型改革，完成20个湘药拳头新药品的研制，使中药成药达到“三效一小”(速效、长效、高效、体积小)的要求，并组织创办骨干企业，使研制的新产品投入批量生产，实现年总产值达到10亿元，创利税2亿元，创汇1亿元。湖南省政府批准这一实施计划后，省卫生厅很快组建了一个科、工、贸结合一体的经济实体——湖南省国药开发总公司，公司本部先配备了人员编制50人，设置了有关职能机构，全面展开了一系列的开发工作。省财政将该企业纳入财政预算内企业，省劳动厅将该企业列入大中型企业。随着国企改制，加快医药工业迅速发展，由国企的几十名青年骨干技术职工、专家、教授等科技人才组建了新公司，在新的机制下，换上了新的血液，取得了新生，加快了对外合作，谱写了新品章，批准进入了湖南岳麓山大学科技园发展。
公司成立后，首先充分发挥医疗卫生科研单位的技术优势，组织了科研工作。公司自身建立了一套严密的管理体系，确定了是四个科研基地：(一)湖南南药实验加工厂 (二) 两个南药种子种苗基地 (三) 三个南药研究中心 (四) 四 个南药种植基地，在此基础上，组7EC7了300多家大中型医院及单位参加的医药开发科研协作网，如：中国中医药研究院、北京中医药大学、上海二军医大、北京华大基因研究中心、湖南医药股份有限公司等，已经完成开发研制属于本公司专利。
湖南国药开发总公司经营范围：中药材的种植、研究、开发、加工、生产、销售、基因工程的研究与开发。