强化对内部审计工作的监督。审计机关可以把应当建立而没有建立内部审计机构的单位列为重点审计单位。在出具审计报告时，对被审计单位内部审计制度健全和工作开展情况进行评价。
加强对内部审计业务的指导。审计机关应按照对公共资金、国有资产、国有资源和领导干部履行经济责任情况实行审计全覆盖的要求，将所有相关联的被审计对象全部纳人审计业务指导范畴。全面检查其内部审计工作情况，梳理发现系统性、瞄头性、倾向性问题，有针对性地开展业务指导。
加强对内部审计质量的管理。对内部审计机构开展的重大审计项目，审计机关应在审计法律法规、方式方法等方面提供指导与帮助，必要时派出骨干力量参与审计，进行现场指导。
利用内审成果，彰显内外监督整体合力
要求被审计对象报送内部审计工作报告。一方面通过系统分析，查找行业或单位中存在的系统性、倾向性问题，掌握相关审计线索，让国家审计的关注点更具有针对性。另一方而，增强内部审计工作的权威性，督促被审计单位重视内部审计工作，同时也可以监督内部审计工作的质量。
授权内部审计开展部分国家审计任务。审计机关应完善内部审计管理体制机制的顶层设计，把传统的财政、财务收支审计交由被审计对象内部审计机构承担.根据各行业实际列出负面清单，内部审计机构主要针对负面清单开展审计，并把审计情况报审计机关备案。同时，国家审计机关对一个单位进行审计时，应了解和评价其内部审计工作情况，进行必要的授权委托审计，明确授权的审计任务、审计目标、审计重点和业务流程。审计任务结束后，应对授权的审计工作质量进行重点抽杳和考核评估，确定审计成果的利用程度。
合理利用内部审计成果资源。一是直接利用内部审计成果。审计机关在开展各类行业审计任务时，对内部审计开展较好、质量较高的单位，可以直接采用其内部审计信息、资料、数据。二是督促落实审计整改。对内部审计找出的间题、指出的管理缺陷、提出的可行性建议，审计机关在开展常规审计时，督促所在单位认真落实内部审计结论，帮助其分析问题产生的深层次原因。三是及时总结推广内部审计经验，扩大内部审计影响，激发内部审计机构、内部审计人员的积极性、创造性。
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