酯交换制取生物柴油是当今最容易实现工业化的一种方式。在众多的清洁替代能源中，植物油甲zhi作为柴油的替代品有很多的优点。影响酯交换反应的主要因素有醇油比、催化剂、反应温度和压力、反应时间以及游离脂肪酸和油中水分含量。
目前工业生产生物柴油主要应用酯交换法。各种天然的植物油和动物脂肪以及食品工业的废油，都可以作为酯交换生产生物柴油的原料。可用于酯交换的醇包括甲醇、乙醇、丙tong、丁醇和戊醇。其中最为常见的是用甲醇，这是由于甲醇的价格低，同时碳链短、极性强，能够很快地与脂肪酸甘油酯发生反应，且碱性催化剂易溶于甲醇。该反映可用酸、碱或酶作为催化剂。其中碱性催化剂包括naoh、koh、各种碳酸盐以及钠和钾的醇盐，酸性催化剂常用的是硫suan、磷suan或盐suan。甲醇越多产率越高，但也会给分离带来困难。
下式表明酯交换反应的一般步骤：
通过以上的酯交换反应可以使天然油脂（甘油三酸酯）的分子量降至原来的 1/3，粘度降低 8 倍，同时提高了燃料挥发度。生产出来的生物柴油的粘度与柴油接近，十六烷值达到 50。
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