1、属性不同
旗舰店必须是要求自己的品牌，一般都是厂家自己在卖；而品牌店就是只能卖一家的产品，这家店只能卖同一个品牌；
2、要求不同
旗舰店的话是品牌拥有人或公司自己开的商城店；而品牌店的话是品牌拥有人或公司授权开店，相当于一级经销商或分销商，而且只能在店里买同一个品牌；
3、类型不同
旗舰店是官方的；品牌店是官方授权的；
4、责任不同
旗舰店要对品牌或公司负责；而品牌店要对品牌负责。
二、商标要求：
1.的话是会选择哪品种型店铺的，而类型不同，入驻请求会有所不同。
tm状态的商标申请入驻需大于申请时间6个月，且在商标网的更新状态为受理通知书发文，商标有效期填写2年。
2.申请中的商标也能够上传但需求同时满足以下两个条件：
（1）申请时间距今要大于6个月。
（2）申请时间距今要小于2年（超越2年未申请胜利的商标暂不支持入驻）。