分居期间的子女抚养费是由夫妻共同承担的。分居期间，夫妻关系还在存续中，抚养权还是属于子女的父母，父母抚养权并没有影响。父母对未成年子女负有抚养、教育和保护的义务。夫妻双方平等享有对未成年子女抚养的权利，共同承担对未成年子女抚养的义务。谁来承担分居期间子女抚养费的法律依据
《民法典》第二十六条
父母对未成年子女负有抚养、教育和保护的义务。
成年子女对父母负有赡养、扶助和保护的义务。
第一千零五十八条
夫妻双方平等享有对未成年子女抚养、教育和保护的权利，共同承担对未成年子女抚养、教育和保护的义务。
第一千零六十七条
父母不履行抚养义务的，未成年子女或者不能独立生活的成年子女，有要求父母给付抚养费的权利。