基质装盘后播种前将盘浸放到水槽中，育苗盘，水从穴盘底部慢慢往上渗，吸水较均匀，芽菜育苗盘，然后再放入苗床内。
穴盘内育苗的基质容量小，空隙度大，可吸纳的水分较少，苗床对幼苗供水的缓冲性小，稍有疏忽，易产生失水现象，蔬菜育苗盘，夏秋高温季节要在清晨和傍晚气候凉爽时及时喷洒水分。
统一播种和管理，使小苗生长发育一致，提高种苗品质， 有利于规模化生产。
瓜类等大粒种子的穴孔基质不可太满
在不恰当的时间或者用错误的方式浇水，会严重影响穴盘苗的生产。
育苗盘
使用育苗盘育苗运输方便。在运输车里穴盘可以立体多层摆放，非常适宜远距离运输。从播种室运到成苗室，或把穴盘苗从高温处移到低温处、从相对弱光处移到强光处，或从育苗室运到耕地里定植都很方便。
育苗盘节省种子用量，降低生产成本。出苗整齐，保持植物种苗生长的一致性，种植育苗盘，能与各种手动及自动播种机配套使用，便于集中管理，提高工作效率
常见的几种蔬菜种子都需要在黑暗条件下才能顺利萌发，所以选择恰当的覆盖物也很重要。覆盖物的选择要考虑几个方面：可以提高种子周围的湿度、保持良好的透气能力
栽培中、小型种苗，以72--288孔穴盘为宜。
移栽时不损伤根系，缓苗迅速，成活率高
采用穴盘育苗培育的秧苗具有苗龄短、幼苗整齐、健壮、无病虫害、定植后还苗快等优点。利用穴盘可集中育苗、统一管理，育苗时期不受环境限制
苗期管理。移苗补缺：出苗后要及时将苗床上覆盖的地膜揭去，防止揭膜过迟而形成“高脚苗”。待子叶展开后就要立即进行间苗和移苗补缺，将单多余的苗拔起移入缺苗的空，同时将多余的苗删除，缺苗移补好后，立即对苗床喷洒清水。
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