火车退票扣手续费费用是按照退票的时间来确定的。火车票退票手续费新规定实行梯次退票，网上退票手续费和其他退票方式扣费是一样的。对开车前15天（不含）以上退票的，不收取退票费。票面乘车站开车前48小时以上的，退票时收取票价5%的退票费;开车前24小时以上、不足48小时的，退票时收取票价10%的退票费;开车前不足24小时的，退票时收取票价20%退票费。
根据《铁路旅客运输规程》第四十八条旅客要求退票时，按下列规定办理，核收退票费：
（一）旅客退票必须在购票地车站或票面发站办理。
（二）在发站开车前，特殊情况也可在开车后2小时内，退还全部票价。团体旅客必须在开车48小时以前办理。
（三）旅客开始旅行后不能退票。但如因伤、病不能继续旅行时，经站、车证实，可退还已收票价与已乘区间票价差额。已乘区间不足起码里程时，按起码里程计算;同行人同样办理。
（四）退还带有字戳记的车票时，应先办理行李变更手续。
（五）因特殊情况经站长同意在开车后2小时内改签的车票不退。
（六）站台票售出不退。
市郊票、定期票、定额票的退票办法由铁路运输企业自定。必要时，铁路运输企业可以临时调整退票办法。
二、火车票丢了可以补办吗
火车票丢了可以补办。火车票凭二代身份证直接检票乘车后或者已乘车车票遗失需要报销做凭证的可以补打，需要车站人工窗口换取纸质车票，仅作为报销凭证。
《中华人民共和国铁路法》第十四条旅客乘车应当持有效车票。对无票乘车或者持失效车票乘车的，应当补收票款，并按照规定加收票款；拒不交付的，铁路运输企业可以责令下车。
三、火车票退票发票怎么拿
只要在办理准备好有效的身份证件和退票交易成功时提供的订单号码，就可以取得火车票退票费报销凭证。当然在网上办理退票之后要注意去车站售票窗口索取退票费报销凭证的时限。