(一)匀浆法
匀浆(homogenization)是z常用的破碎细胞的方法，一般都要在冰上操作。较为经济的方法是使用玻璃匀浆器。手动玻璃匀浆器由一根端部表面磨砂的玻璃杆和一个内壁磨砂的玻璃套管组成。使用时，先用锋利的刀片把组织块切碎，然后把碎块加入套管中，用力移动玻璃杆使组织细胞破碎。因为在研磨的过程中会摩擦产热，引起蛋白变性，所以一般都在冰上操作，冰上操作还可以抑制细胞酶活性，防止降解。电动玻璃匀浆器和手动玻璃匀浆器原理和使用方法相似。
(二)高速组织捣碎机法
高速组织匀浆机有高速转动的电机，可以带动钢制转头高速旋转，从而剪切样品、达到破碎细胞的目的，可以用于微量样品的制备。使用时将待处理细胞悬于细胞裂解液中．加入到塑料离心管(因为刀头速度过快，为防止碎裂，尽量避免使用玻璃试管)中，并放置于冰上，将组织匀浆机的探头浸入离心管中，然后打开电源，缓慢调整旋转速度，一般开机数十秒后．组织细胞即可被高速旋转的探头破碎。但不宜时间过长，以防高速旋转产生热而导致分离物中的活性物降解。
(三)超声波处理法
超声波发生器能产生高强度的超声信号，经换能器传送至与之接触的溶液中，由声波形成冲击和振动而产生剪力，致使原代细胞破碎，一般体外培养的动物细胞均可在短时间内破碎，因超声时可产热，应注意冰浴冷却，生物大分子如核酸和酶对超声敏感，一般不宜采用。如果提取蛋白、多糖等，可采用超声法降解核酸。超声法可以和匀浆法相结合，即先通过匀浆的方法破碎细胞，再通过适当的超声进一步裂解。
(四)化学裂解法
在细胞悬液中加入titon x-100、np-40、sds、去氧胆酸钠均可使细胞裂解，往往仍需机械法进行辅助，方可在短时间内使细胞*裂解，裂解后应清除化学裂解剂，以防止干扰分析。这些化学物质往往配制成细胞裂解液。
(五)反复冻融法
可将细胞悬浮于细胞裂解液在一70℃或液氮中冷冻后，迅速于37℃融化，经3—4个冻融周期．可使原代细胞破碎。如果结合超声法，一般来说效果会更好。