一、开机
1.打开氦气钢瓶总阀，调节减压阀使压力指示为0.5mpa。
2.打开电脑并进入nt界面，然后打开gc开关并使仪器完成自检，再打开msd开
3.点击电脑桌面上的“instrument”图标，进入工作站，在听到“嘟”的一声后，仪器和电脑连接成功。msd将自动进入抽真空、离子源及四极杆升温的程序。
二、方法编辑
1.在instrument窗口的栏中，从method菜单中选取edit entire method进入方法编辑步骤。
2.在工作站的提示下，设定好以下参数：进样口温度、进样模式、分流比、柱温、载气流速等其它一些相关参数。
3.设定完毕后，给编辑的分析方法命名并保存。
三、数据采集
单个样品分析：
1.从instrument control视图中，单击绿色图标，编辑待测样品文件名称、样品名称等相关信息。
2.单击start run，如采用自动进样方式会退出次面板并开始采集，如采用手动进样方式，需按提示先在gc面板按予运行键，然后进样、在gc面板上按start键。
序列分析：
编辑进样序列相关参数，序列参数表设定完后，点击“序列”中的“运行”，填入一些关于样品的信息(操作者、文件保存路径等)。将样品放入自动进样器中，基线平衡15min以上时便可进样。
四、数据分析
1.点击电脑桌面的“data analysis”图标，进入数据处理系统。
2.选择file/load data file，在目录下查找并调出所需文件。
3.将鼠标移至所要分析的色谱峰，双击鼠标右键，得到该色谱峰的质谱图，系统将自动给出该色谱峰可能对应的化合物的结构式等信息。
4.在data analysis窗口的栏中，选取method/edit method进入积分参数的编辑步骤。选取chromatogram/integration results察看积分结果。
五、关机
1.将仪器的进样口及柱箱的温度降至室温。
2.在instrument control界面中选取view/diagnostics/vaccum control。
3.在diagnostics界面选取vaccum /vent，仪器进入放空状态。
4.放空完成后关闭工作站及电脑，然后关闭gc、msd，后关闭氦气钢瓶。