1.一旦扫描仪通电后，千万不要热插拔scsi、epp接口的电缆，这样会损坏扫描仪或计算机。当然usb接口除外，它本身就支持热插拔。
2.扫描仪在工作时请不要中途切断电源，一般要等到扫描仪的镜组完全归位后，再切断电源，这对扫描仪电路芯片的正常工作是非常有意义的。
3.一些ccd的扫描仪可以扫小型立体物品，但在扫描时应当注意：放置锋利物品时物品不要随便移动，以免划伤玻璃，包括反射稿上的订书针，放下上盖时不要用力过猛，以免打碎玻璃。
4.一些扫描仪在设计上并没有完全切断电源的开关，当用户不用时，扫描仪的灯管依然是亮着的，由于扫描仪灯管也是消耗品（可以类比于日光灯，但是持续使用时间要长很多），所以建议用户在不用时切断电源。
5.扫描仪应摆放在远离窗户的地方，因为窗户附近灰尘较多，而且受到阳光的直射，塑料部件的使用寿命会减短。
6.由于扫描仪在工作中会产生静电，吸附大量灰尘进入机体，影响镜组的工作，因此不要用容易掉毛的织物来遮盖（绒制品、棉织品等），可以用丝绸或蜡染布等来遮盖。房间内适当的湿度可以减少灰尘对扫描仪的影响。