英文名称：microbial genomic dna standards for sequencing performance assessment(mg-001, mg-002, mg-003, mg-004)
品牌：nist
规格：4 vials, 1 each
运输信息：干冰
rm 8375 微生物基因组dna在用于微生物全基因组测序的验证、优化、过程评估和性能评估。特别注意评估基因组序列。该材料旨在帮助评估高通量微生物 dna 测序方法的性能。该基因组 dna 已从细胞培养物中提取。因为 rm 是提取的 dna，所以它不评估 dna 提取等分析前步骤。然而，它确实对测序文库制备、测序机器、碱基调用算法和随后的生物信息学分析提出了挑战。此 rm 并非旨在评估其他生物信息学步骤，例如菌株鉴定、系统发育分析或基因组注释。基因组 dna 的纯度被评估为适合这些目的。
rm 8375的一个单元由四个小瓶组成。每个小瓶包含不同的微生物基因组 dna 样本（mg-001 鼠伤寒沙门.氏菌 lt2、mg-002 金黄色葡萄球.菌、mg-003 铜绿假单胞菌和 mg-004 产孢梭菌）。
储存和使用说明
储存：
rm 8375 微生物基因组dna 在 nist 的 –20 °c 温度下储存，但将与冷冻包装一起运输，并且可能不会冷冻到达。收到后，rm 8375 应在 –20 °c 的黑暗中长期储存，或在 4 °c 的黑暗中短期储存（如果使用时间可能在大约 8 周内）。
用途：
建议使用基因组序列来评估变异调用的准确性，而不是基因组组装，因为正交测量方法对基因组序列结构存在分歧，并且无法解决差异。由于与用于评估碱基调用准确性的方法相关的复杂性以及基因组序列中的潜在错误，强烈建议用户手动检查具有高碱基调用错误率的推定区域周围的对齐读数。参考文献 3 概述了评估微生物基因组中变异调用的最佳实践。
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