灭菌器由于湿热灭菌的经济性、有效性、无化学残留和便于控制，凡是能够耐受湿热的物品，均应选择湿热灭菌，即压力蒸汽灭菌方法。目前医院复用医疗物品的灭菌，90%以上采用压力蒸汽灭菌方式。
灭菌器湿热灭菌机理
水分子存在的条件下对微生物进行加热，可以使蛋白质分子内的氢键破裂，最终导致蛋白质变性，而蛋白质是细胞内遗传物质的载体，或酶活反应的主要成分，蛋白质的变性导致细胞死亡，从而产生杀菌作用。同时，水分比空气传热性能更好，蒸汽冷凝时，释放大量潜热,同时,体积急剧缩小所引起的真空效应也更利于蒸汽穿透。这些特点使湿热灭菌比干热灭菌效果更好。