一、印刷准备工作
(1)开机前，首先要启动空气压缩机，使压缩机储气罐有足够的气压后，水性印刷机才能进行锁车，网纹辊升降、起动隔膜泵等各项工作。
(2)瓦楞纸箱水性印刷所使用的版材，主要有橡胶版和感光树脂版两种类型。橡胶版通常是7mm厚，而感光树脂版的厚度有多种不同的规格，如2.54mm、3.94mm及4.32mm等。
在实际生产过程中，如果在同一块印刷挂版上使用了不同类型或是不同规格的版材，印版的版面高度就有可能不一样，局部印刷压力也就会不一致，进而影响到印刷质量，出现诸如印不上油墨、图文墨色深浅不一以图形和文字变形严重等问题。
因此，有必要对印版版面高度进行调整，在薄版的背面粘贴相应厚度的衬垫物，使印版版面平整、高度一致。当然，同一版面最好使用同一种类型和规格的版材。
(3)水性印刷机采用短墨路的输墨循环系统，如图1所示。水性油墨在此系统中形成一个封闭的循环，即：
墨桶——吸墨管——隔膜泵——储墨罐——由橡胶辊与网纹辊相挤压而形成的墨槽——回墨管——(流回)墨桶。
因此，操作人员在进行油墨的准备时，需要注意的是：先使网纹辊上升(与印版滚筒脱离接触)，然后启动隔膜泵吸墨，最后启动橡胶辊电机(工作)。这样做的目的就是要避免橡胶辊与网纹辊之间无墨转动，磨损橡胶辊与网纹辊。
(4)推纸板的后极限位置调节。首先将瓦楞纸板的前边沿靠齐前齐纸板，然后再根据瓦楞纸板的后边沿，调整好推纸板的后极限位置。推纸板的工作位置要求：瓦楞纸板的后边沿正好落在推纸板的斜面上，如图2所示。否则，就会出现以下两种情况：
①当推纸板的后极限位置调整偏前时，推纸板在其工作的行程范围内将起不到推送瓦楞纸板的作用；
②当推纸板的后极限位置调整偏后时，推纸板又会出现推送的纸板歪斜。烂纸甚至卡住的输纸故障。
二、印刷操作
(1)开机印刷时，首先启动印刷机主机，待印版滚筒转动起来之后，再降下网纹辊向印版供墨。这是因为水性印刷机的橡胶辊采用单独电机驱动，始终处于转动状态，若在印刷过程中，还未启动印刷机主机，就会让处于静止状态的印版滚筒与网纹辊接触(如图3所示)，印版版面就会出现一边堆墨的现象。
(2)在印刷套准中轴向调节印版滚筒时，最好等印版滚筒停止转动再进行，否则调节手轮会随印版滚筒转动，调节的位移量不易把握，因而达不到理想的调节效果。
三、安全操作
(1)在启动印刷机主机前，一定要先把印刷机的速度设定旋钮设在“0”的位置。进行纸箱印刷时，再慢慢顺时针转动“速度设定”旋钮，提高印刷速度，使设备平稳运行，以延长使用寿命。同样，在停机前，也必须把印刷速度逐渐降低到零速之后，再停机。
(2)在纸箱印刷的全过程中，空气压缩机必须始终处于开启状态。只有这样，空气压缩机在气压不足时才会自动启动，保持工作气压的稳定。否则，印刷机会因气压不足而造成以下故障：
①网纹辊下降力量不足，印版版面上墨不匀上墨；
②输墨系统的隔膜泵停止工作，吸墨中断；
③输纸装置与印刷机组之间或各印刷机组之间无法实现分离或合拢停锁。
(3)当输纸装置与印刷机组之间或各印刷机组之间需要分离时，必须等主机完全停稳后才能进行，否则传动齿轮的相位会产生相互错位，再次闭合时就会出现撞齿，印刷机无法合拢停锁。
(4)操作人员进行拆装印版或是清洗印版版面操作时，需先将输纸装置与印刷机组之间或各印刷机组之间分离开，再按下“锁车”按钮，锁住输纸装置和印刷机组，防止意外事故的发生。操作人员有必要养成良好的操作习惯，不要贪图一时之便。
(5)正确的开机操作规程是：先接通印刷机电源，再启动空气压缩机，然后进行印版。油墨及瓦楞纸板的准备工作。等到以上工作依次完成后，就可以启动印刷机的主机，逐渐提高印刷机的运行速度，接着按下“网纹辊下降”按钮<即向印版供墨)，再按下“抽风送纸”按钮，就可以进行试印刷了。
(6)正确的停机操作规程是：先停止抽风送纸，接着按下“网纹辊上升”按钮(即停止向印版供墨)，逐渐降低印刷机的运行速度，直至速度为零，最后按下“停车”按钮，停止印刷机的主机运行。