1、窖藏。窖藏时包装的方法有以下几种：一是将辣椒装入衬有牛皮纸的筐中，筐口用牛皮纸封严，堆码在窖内；二是将蒲包用0.5%的漂白粉消毒，洗净，沥去滴水，衬入筐内，把辣椒装入其中，堆码成垛，每隔5～7天更换1次蒲包，如果空气中湿度较大，可将湿蒲包套在筐外；三是将辣椒装入筐中，外罩塑料薄膜；四是临时储藏窖藏，常采用散堆方法，厚度约为30厘米，为降低堆内温度和增加湿度，可在辣椒堆下挖数条小沟，必要时向沟内灌适量的水。
2、埋藏。分为沙埋、灰埋与糠埋3种，在室内外均可。
3、缸藏。用0.5%～1%的漂白粉溶液将缸洗涤消毒；选皮厚、蜡质层较厚的辣椒果实，经药物消毒后将果柄朝上摆在缸内，摆1层辣椒铺1层沙，每层沙的厚度以不见辣椒为宜，一直摆至近缸口处，上面用两层牛皮纸或塑料薄膜封住，使辣椒基本上不受外界空气的影响，保持较高的湿度；然后将缸放在阴凉处或棚子里，储藏中每隔5～10天揭开封口透气10～15分钟，如天气转冷，缸口加盖草帘，缸四周也用草帘防寒。缸储辣椒在0℃条件下可储藏2个月左右，好果率达90%以上，但要注意缸内温度不要太高，沙子最好用较干的细沙，以免烂果。
4、沟藏。选地势较高，地下水位较低的地方，在露地背阴处挖宽0.7～1米、深1～2米的沟，长根据储量确定，沟底铺填4厘米厚的细沙（也可用稻壳等），摆1层辣椒铺1层沙，排4～5层，最上一层离地面35厘米左右。也可装筐放入，面上加秫秸或竹竿，再盖草苫，草苫厚度随气温变化增高或降低。沟藏须设置防雨设施，以防雨雪漏入沟内引起腐烂。