增施有机肥，苹果新品种苗，改善土壤理化性状，提高土壤肥力，调整土壤酸碱度，也是好的补钙措施。
科学施肥、平衡施肥。在合理施用氮、磷、钾肥的基础上补充钙、硼、镁、硅等元素。当前主要问题是氮、钙比例失调。要大限度地减小氮的使用量，新品种苹果树苗，同时增加过*钙、石灰等含钙肥料。如果使用钙和铵钙，需要减少其他氮肥的使用量，短枝形苹果新品种，好的办法是使用波美度方便实用。
目前，普遍认为苹果苦痘病与果实缺钙有关，科学家确实观察到得了苦痘病的苹果中钙和硼含量低，而氮、钾、磷和镁含量都高于正常果实；套袋在一定程度降低了果实的蒸腾速率和钙的含量，但也发现喷钙不能完全阻止苦痘病的发生。对比调查发现：品种特性、树体养分、树势、树体负载量、采收时期以及贮藏环境等因素都会影响发病率。而且，往往是在我们用肥多，苹果长势喜人，果实个大，以为一定是个大丰收的时候，苦痘病却严重发生了。
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