套牌车发生交通事故的赔偿方式为：应当由套牌车车主承担交通事故损害赔偿责任。如果套牌车逃逸无法查获，且原车主不能排除肇事车归其所有并套牌使用的情况下，事故损害赔偿责任由被套牌的原车主承担。但是赔偿之后，被套牌车主可以向套牌车主进行追偿。套牌车发生交通事故怎么赔的法律依据
《最高人民法院关于审理道路交通事故损害赔偿案件适用法律若干问题的解释》第三条套牌机动车发生交通事故造成损害，属于该机动车一方责任，当事人请求由套牌机动车的所有人或者管理人承担赔偿责任的，人民法院应予支持；被套牌机动车所有人或者管理人同意套牌的，应当与套牌机动车的所有人或者管理人承担连带责任。