专利申请权一般是不能直接出资的。如果要以专利权作为出资，那么只能以专利权的物权出资，而不是申请专利权的权利。
我国《公司法》第27条规定：股东可以用货币出资，也可以用实物、知识产权、土地使用权等可以用货币估价并可以依法转让的非货币财产作价出资；但是，法律、行政法规规定不得作为出资的财产除外。
《公司法》第28条对专利权出资的认定方式为：以非货币财产出资的，应当依法办理其财产权的转移手续。专利使用权作为专利权的一部分，是可以用货币估价并可以依法转让的。虽然专利使用权价值低于知识产权所有权的价值，在没有法律明确禁止的情况下，可以作为出资设立公司。
二、专利申请权和专利权是否可以转让
专利申请权与专利权可以转让。在权利人为两人或两人以上的情况下，专利申请权与专利权的行使方式由共有人约定。没有约定的，共有人可以单独实施或者以普通许可方式许可他人实施该专利，不能做出独占或排他许可。同时，权利人在许可他人实施该专利时，收取的使用费应当在共有人之间分配。
根据《中华人民共和国专利法》第十条专利申请权和专利权可以转让。
中国单位或者个人向外国人、外国企业或者外国其他组织转让专利申请权或者专利权的，应当依照有关法律、行政法规的规定办理手续。
转让专利申请权或者专利权的，当事人应当订立书面合同，并向国务院专利行政部门登记，由国务院专利行政部门予以公告。专利申请权或者专利权的转让自登记之日起生效。
第十五条专利申请权或者专利权的共有人对权利的行使有约定的，从其约定。没有约定的，共有人可以单独实施或者以普通许可方式许可他人实施该专利；许可他人实施该专利的，收取的使用费应当在共有人之间分配。
三、专利权的内容都有哪些
专利权的内容有以下几个方面的内容：
1.独占实施权
专利权人对其专利产品或者专利方法依法享有的进行制造、销售或者使用的专有权利。
2.进口权
将专利权人在专利权的有效期限内依法享有的禁止他人未经许可或授权，以经营为目的的进口专利产品的权利。
3.转让权
专利权人将其获得的专利所有权转让给他人的权利。
4.实施许可权
专利权人通过实施许可合同的方式，许可他人实施其专利并收取专利使用费的权利。
5.标记权
专利权人享有在专利产品或者该产品的包装上、说明书上、产品广告上作上专利标记和专利号的权利。