电磁流量计一般用水校准，气体用空气校准。若知道实际测量流体与校准流体间某些物性不同对示值有规律变化时，中大管径流量仪表常以适当系数修正。电磁流量计受黏度等流体物性影响大，须以实际使用流体校准。所幸流量小，用实际使用流体校准难度不大，但在作有害性流体校准时应注意安全和环境污染。
电磁流量计若测量洁净气体和纯水常不允许接触流体的仪表零件材料析出离子，例如半导体制备中仪表不能用金属和玻璃制成，只能用塑料。流体中也不容许混入活动件的磨蚀尘粒。流量仪表流通通道要尽可能简单，不应有潴留部位，防止潴留介质变质。
