违章建筑超过2年不允许强拆是不合法的。根据行政法的规定，对违法行为两年以上未发现处理的，不再追究。但专是违章建筑（现在叫违法属建筑）不在此列，只要违法事实存在，违法后果存在，是一样要依法追究的。 违章建筑超过2年不允许强拆的法律依据
《国有土地上房屋征收与补偿条例》第二十八条
被征收人在法定期限内不申请行政复议或者不提起行政诉讼，在补偿决定规定的期限内又不搬迁的，由作出房屋征收决定的市、县级人民政府依法申请人民法院强制执行。
强制执行申请书应当附具补偿金额和专户存储账号、产权调换房屋和周转用房的地点和面积等材料。