色谱柱由管子和固定相组成，结构形状多样，常见的有u形和螺旋形，长度从几厘米到百米，内径由 mm到 mm常用的固定相有石墨化炭黑、分子筛、硅胶和高分子有孔性微球等
色谱柱是色谱仪的关键部件，它的质量好坏对仪器的性能有很大影响，由于固定相的多样性，色谱法能分析的混合气十分广泛但没有一种能分析所有混合气的色谱柱，必须根据 被分析混合气的性质选择合适的固定相。
色谱柱的分离性能与操作条件有关，操作条件包括柱长、柱沮、载气性质、压力、流量以及被测混合气的进样量。为了维持柱温恒定，设有色谱柱沮度自动控制装置。
当色谱柱和操作条件确定后，各成分流过色谱柱的时间是恒定的，可以根据此时间来区分各成分。