一般来说，番茄整枝方式较多，菜农朋友可以采用其中的“单干三穗果”方式进行。当植株的第三花序坐果后，及时在主茎第一穗果下方保留1-2条健壮的侧枝，然后将其余侧枝全部摘除。同时，打掉基部附近的老、病、弱叶片，以增加株间的通风透光效果，进而促进侧枝健壮生长。
当最后一穗果成熟采收后，在距侧枝上部4-5公分处，减掉衰老的主茎，以促进侧枝代替主茎生长，从而达到二次开花结果目的。
为了侧枝健壮生长，建议整枝完成时，同步在植株附近开浅沟，每亩施磷酸二氢铵25-30千克+硫酸钾15-20千克。
如果采用埋茎的方式，进行秋延栽培。那么，埋茎时需要注意：
在第一茬番茄成熟采收后，及时拔除长势较弱、有损伤或病害的植株，保留生长健壮的植株。其中，在保留的植株中，还要剪掉枯死的枝叶，只保留旺盛的新枝。然后，再原垄附近挖一条浅沟（深度在10-13公分），将主茎轻轻压在沟内，并适当覆土埋茎。
为了确保植株生长所需养分，建议在埋茎前，在沟内追施适量化肥，一般每亩追施磷酸二氢铵25-30公斤+硫酸钾15-20公斤，可以促进被埋部位快速生根，进而培育出新的长势旺盛的植株，达到二次开花结果目的。