边境仓与海外仓的区别在于，海外仓位于境外目的地，而边境仓则位于商品输入国(地区)的邻国。同时，对于边境仓而言，仓库的位置可以分为相对边境仓及绝对边境仓两种。相对边境仓也就是仓库设立在与商品输入国(地区)不相邻却相近的国家(地区)，而绝对边境仓则是仓库设立在与商品输入国(地区)相邻的国家(地区)。目前中国的边境仓主要指的是临近俄罗斯的边境仓，主要服务于俄罗斯及俄语地区;也有一小部分建在新疆地区，主要服务于中东和中亚地区。
边境仓有很多的作用。首先，边境仓对于提高物流时效作用非常明显，以俄罗斯边境仓为例，15~20天即可送达俄语地区。其次，相比海外仓，边境仓里的货物安全更有保证，能够避免海外货物存储的风险，也避免了使用海外仓大宗货物要涉及的烦琐的清关流程。再次，对于海外仓而言，边境仓的成本优势也比较明显，因为边境仓建在境内，国内的成本相对于俄罗斯等国家更加有优势。最后，边境仓因为离目的国(地区)距离较近，所以国际运费也更加便宜，并且边境仓的国际物流可以接驳陆路运输方式，陆运和空运相比成本较低，而且对运输的货物限制较少，只要不是相关国家(地区)明令禁止的货物基本都可以运输。