国际空运是以航空公司的航空飞机作为运载工具，运作方式是机场到机场。而国际海运，是以船运公司的船只作为运输工具，运作方式是港口到港口。
2、运输主体
国际空运的运输主体是各大航空公司、物流公司;国际海运的运输主体是各大船运公司。
3、物流时效
由于在运输工具上的区别，导致它们在抵达相同国家的物流时效有很大的差异，其中国际空运使用飞机，时效快捷，而国际海运使用船只，时效缓慢。
4、物流费用
国际空运与国际海运在资费上也有较大的区别，空运虽然物流时效快，但是运输成本高，因此资费比较昂贵。而国际海运，运输成本低、承运能力强，因此资费比较低。
5、查验方式
国际海运有时要提箱、掏箱，耗时间，成本高;会产生查验费，也可能有装卸费拖车费等;而国际空运送货时查验，实行“先查验后入仓”原则，速度快，一般没有查验费。
6、清关方式
国际空运与国际海运虽然在清关流程上没有太大的区别，但在清关时效上有较大的区别。国际空运清关通常1-2天内就能搞定，而国际海运则需要3-4天左右。