1.物流成本事前控制
物流成本事前控制是指运用目标成本法进行物流成本控制，或者采用预算法进行控制，属于前馈控制。目标成本法是指经过物流成本预测和决策，确定目标成本，并将目标成本进行分解，结合经济责任制，层层进行考核。物流成本事前控制主要内容包括物流系统的设计，如配送中心、仓库的建设，物流设施设备的配备，物流信息系统的建设，作业流程的改进优化等。据估计，60%〜80%的物流成本在物流系统的设计阶段就已经确定了，因此物流成本事前控制是物流成本控制最重要的环节，直接影响到物流作业流程成本的高低。
2.物流成本事中控制
物流成本事中控制是指运用标准成本法进行物流成本控制，也就是日常控制。它对物流过程中所发生的各项费用（如设备费用、人工费用、工具费用和其他费用支出等）按预定的成本费用标准，进行严格的审核和监督，计算实际费用和标准之间的差异，并进行分析，一旦发现偏差，釆取措施加以纠正，及时进行信息反馈。
3.物流成本事后控制
物流成本事后控制是指在物流成本形成之后，对物流成本的核算、分析和考核，属于反馈控制。物流成本事后控制通过实际物流成本和标准的比较，确定差异，分析原因，确定责任者，对物流成本责任单位进行考核和奖惩。通过分析，为企业今后的物流成本控制提供意见和措施，制定物流成本控制制度，从而降低物流成本。