当事人非法经营，但是公安机关没有物证的，如果其他证据能够形成证据链，证实犯罪事实的，应当以非法经营罪定罪量刑；如果不能形成证据链，证据不足的，法院应当作出证据不足、指控的犯罪不能成立的无罪判决。非法经营没有物证怎么处理的法律依据
《刑事诉讼法》第二百条在被告人最后陈述后，审判长宣布休庭，合议庭进行评议，根据已经查明的事实、证据和有关的法律规定，分别作出以下判决：（一）案件事实清楚，证据确实、充分，依据法律认定被告人有罪的，应当作出有罪判决；（二）依据法律认定被告人无罪的，应当作出无罪判决；（三）证据不足，不能认定被告人有罪的，应当作出证据不足、指控的犯罪不能成立的无罪判决。