数控钻孔机是高精度、高效率的自动化设备，但由于钻孔数量大、连续加工发热等因素影响工件的精度，自动控制不能进行人工干预所以在设计要求上比通常用的钻孔机更严格、制造要求更精密。新的研发技术加强刚性、减少热变形，提高精度等方面做出了相应措施。
1.在钻头接触面的过程中，使用喷头进行冷却液的喷射。利用钻孔机的最近回流设计出让切削液在整个机床运行的时候进行冷却钻头与零部件，伺服系统控制冷切液的开关，让钻孔机在工作过程中进行喷射。目的是让钻头在高速与长时间的工作下冷却，减少工件的变形与断钻头问题，让钻头使用寿命更长，达到高效率的加工设备要求。
2.在抵抗由于挤压力与其他力引起的变形与误差，再设计钻孔机的时候会选择刚性好的材质，刚性要比普通机床高50%，在加工过程中承受各种外力的作用，其目的是也是为了提高生产效率，减少变形及提高工件精度。
3.合理的结构布局，立式钻孔机是针对于加工中心进行改良，主轴中心位于立柱的对称面内，主轴控制与伺服系统控制都在机座下方进行安置，方便检查与故障维修。在给进同时利用滑轨丝杆的刚性与耐磨度进行操控，在结构特点上确实比普通机床要使用耐久。
在钻孔机的机械结构特点都是围绕着：高效率、高精度、寿命长的特点，再设计改良上与刚性精度修改，大部分的数控钻孔机都是采用了动力给进的方式进行操作。