阜阳港有界首、太和、颍上、阜阳等14个作业区，设计年港口吞吐能力367万吨。主要有阜阳港界首作业区、阜阳港太和作业区、阜阳港颍上作业区。共有生产性码头泊位109个，其中300吨级泊位4个；港区岸线长度4.81千米，生产用仓库2748平方米，生产用堆场77969平方米；铁路专用线2条，总长7957米，其中装卸线长度1600米；全市辖区内拥有18家水运企业、3170艘运输船舶、118万吨运力，可以承接各种货船代理，豫、皖直达江、浙、沪的铁、公、水联运业务和直达闽、粤、琼的江海河联运业务。
2008年5月27日，省交通厅在阜阳召开阜阳港总体规划审查会议，对阜阳港总体规划进行评审。
阜阳是淮河水系重要的港口城市，阜阳港2006年被省政府规划为全省8个重点港口之
一。阜阳煤炭储量达80多亿吨，农副土特产品较多，淮河流域平均出境水m319亿立方米，水运条件得天独厚。此次规划中，阜阳港到2025年货物吞吐量将达到2000万吨，形成以阜阳、颍上2个主要港区为龙头，以太和、界首、临泉和阜南4个一般港区为依托，重点突出、层次分明、布局合理、大小结合的阜阳港体系，具备现代化港口通信、装卸、存储功能，以及科学的运输组织管理功能、促进临港工业发展功能和高质量的生产、生活服务功能。