答复发明专利实质审查意见的方式为：指出发明专利存在的问题，意见陈述书应当有针对性的陈述。避免仅引用专利法及其实施细则的相关法律规定、而缺少针对性的答复意见。从技术领域、技术方案、技术问题以及技术效果等角度结合实际案情在意见陈述书中进行有理有据地陈述。如何答复发明专利实质审查意见的法律依据
《专利法》第三十四条国务院专利行政部门收到发明专利申请后，经初步审查认为符合本法要求的，自申请日起满十八个月，即行公布。国务院专利行政部门可以根据申请人的请求早日公布其申请。第三十五条发明专利申请自申请日起三年内，国务院专利行政部门可以根据申请人随时提出的请求，对其申请进行实质审查；申请人无正当理由逾期不请求实质审查的，该申请即被视为撤回。国务院专利行政部门认为必要的时候，可以自行对发明专利申请进行实质审查。