一、公司合同违约金合法吗
（一）如果合同当事人的双方在签订合同的时候，对违约金的相关的金额进行了协商，那么就要按照合同的约定履行。
（二）当合同的当事人双方出现一方违约的时候，就要按照合同约定好的违约金数额对对方进行补偿。
（三）我国的相关法律对于违约金的补偿也是有明确的法律效应和规定的。此外，如果合同双方当事人没有对违约金的具体金额进行约定，也可以对如果违约的一方出现，那么违约金可以按照因为违约而造成的经济损失的具体数额，进行赔偿额的计算方式来定违约金。
（四）如果约定的违约金，远远低于给对方造成的经济损失，那么受损失的一方可以到法院要求提高违约金数额。
二、关于合同违约金规定
违约责任的常用形式——约定违约金
《民法典》当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金，也可以约定因违约产生的损失赔偿额的计算方法。
约定的违约金低于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以增加;约定的违约金过分高于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以适当减少。
当事人就迟延履行约定违约金的，违约方支付违约金后，还应当履行债务。
三、合同违约金要缴纳增值税吗
《中华人民共和国增值税暂行条例》第六条将销售额定义为：纳税人销售货物或者应税劳务向购买方收取的全部价款和价外费用。营改增后，《财政部 国家税务总局关于全面推开营业税改征增值税试点的通知》（财税〔2016〕36号）也明确指出，销售额，是指纳税人发生应税行为取得的全部价款和价外费用。
如果产生的违约金是其支付的补偿，是依附于这一应税业务的，符合价外费用的定义特征，就应当缴纳增值税。比如逾期发货，所以赔偿补偿金的，或者购房合同虽然没履行，但是房产中介服务已发生的，就符合上述阐述，缴纳增值税。
如果违约金不依附于增值税应税业务而独立存在，是独立存在的补偿款，就不属于增值税的价外费用，不用缴纳增值税。比如签订了购销合同，但是由于种种原因，彼此取消了合同，从而支付的违约金就不用缴纳增值税。
以上就是小编为您详细介绍关于公司合同违约金合法吗的相关知识，根据上文的介绍，我们可以得知对于合同里的违约情况发生之后，是需要进行赔偿的。如果您还有其他的法律问题，欢迎咨询，我们会有专业的律师为您解答疑惑。