来自美国韦恩大学医学院和密歇根州立大学的研究团队在nature子刊scientific reports发表了题为“targeted expression profiling by rna - seq improves detection of cellular dynamics during pregnancy and identifies a role for t cells in term parturition”的文章,比较了在外显子水平探测转录组的affymetrix人类转录组阵列(hta 2.0)、具有珠蛋白还原的配对末端illumina rna-seq以及一种新型全基因组靶向表达分析技术 drivermap,评估了这些方法在母体全血中定量源自胎盘单细胞基因组的细胞类型特异性特征表达的能力,并确定了这些特征是否能表明足月分娩。
由于器官和/或细胞类型特异性转录本在全血中低表达,因此rna的完整性、稳定性和rna的丰度定量对下游实验至关重要。本研究中使用的血液rna采血管是paxgene全血rna管(bd,762165),该管中含有稳定添加剂,可长时间维持细胞 rna 完整性。
