物流系统是指在一定时间和空间里，由所需位移与服务的物、提供服务的设备(含包装设备、装卸搬运机械、运输工具、仓储设施)、组织服务的人和信息等若干相互制约的动态要素所构成的具有特定功能的有机整体。
物流系统是由运输、储存、包装、装卸、搬运、配送、流通加工、信息处理等子系统组成的复杂大系统。系统输入的是运输、储存、搬运、装卸、包装、物流信息、流通加工等环节所消耗的人力、设备、材料等资源，经过处理转化，变成全系统的输出即物流服务。
跨境电商物流系统是对跨境电商环境下的物流信息进行采集、处理、分析、应用、存储和传播的集成过程。在这个过程中，企业需要对跨境电商物流信息活动的各个要素(人、财、物、技术、工具、设备等)进行管理。
跨境电商物流系统管理用系统化和集成化观念来处理企业经营管理中的各种问题，以达到企业的最优化目标。
当前，跨境电子商务企业大多使用跨境电子商务erp(enterprises resources planning)系统来对企业运营业务进行管理。
跨境电子商务erp系统把传统erp系统中的采购、生产、销售、库存管理等物流及资金流模块与电子商务中的网上采购、网上销售、资金支付等模块整合在一起，以电子技术为手段，以商务为核心，打破国家与地区有形与无形的壁垒，让企业从传统的注重内部资源管理利用转向注重外部资源管理利用，从企业内的业务集成转向企业间的业务协同。