目前消毒工艺有：氯消毒（如氯、二氧化氯、次氯酸钠）、氧化剂消毒（如臭氧、过氧乙酸）、辐射消毒（如紫外线、y射线）等。
氯消毒：
优势：具有持续消毒的作用，工艺简单、技术成熟、操作简单、投加量准确
缺点：产生致癌、致畸作用的有机氯化物（thms）；处理水有氯或氯酚味；氯腐蚀性强、运行管理有一定的危险性
次氯酸钠：
优点：无毒、运行管理无危险性
缺点：产生致癌、致畸作用的有机氯化物（thms）；使水的ph值升高
二氧化氯：
优点：具有强氧化性，不产生有机氯化物（thms）；投放简单
缺点：二氧化氯运行有一定的危险性，只能就地制备，随用随制
臭氧：
优点：具有强氧化性、接触时间短；不产生有机氯化物，不受ph影响，能增加水中溶解氧
缺点：电能消耗大
紫外线：
优点：无有害物质产生、无臭味
缺点：耗电量大